2011年我國生物質能發展緩慢的根源問題還是在于原料，收集困難，運行成本高，企業難以得到回報。如果原料供應短缺，資源收集難度大的問題得不到合理的解決將導致“十二五”規劃的目標難以實現。
我國生物質能資源并不是很豐富，對于農作物來說最后一道應用才是能源，作為生物質能主要原料的秸稈就是其中的典型案例，秸稈還可以用于還田、造紙、直接燃燒等等，最后才會是收集上來用作生物質能，這也就導致生物質能產業運行成本高，企業競爭力低。
另外，我國生物質能技術不是很成熟好用，經常出現問題。比如利用強壓將秸稈等生產為生物質固體成型燃料，運輸儲存燃料磨損嚴重，模具長期使用也需要更換，而且強壓用電能耗大。
雖然出臺了《可再生能源法》，但這是大法、大的政策方向，缺乏具體的實施辦法、細則，中國在稅收、補貼、市場開拓等一系列的優惠政策扶持上尚有很多不足。生物質能產業的良性發展，需要當地政府配合企業建立一套完整的服務體系，比如設定固定的采集站點、采集價格等。同時還需要中石油、中石化等能源行業的大企業在銷售方面提供幫助。
2012年，受國際能源大環境的影響較大�；葌鹘y能源價格走高，生物質能就可能成為熱點。但是由于目前傳統能源還較多，在能源行業里占據主要地位，生物質能還不能成為主角唱大戲。國家也有可能在生物質能行業的發展過程中，發現其他更適于取代傳統能源的能源，也許就會放棄生物質能，生物質能的投資、企業的轉型等又會出現新的問題。(中國農村能源行業協會生物質能專委會秘書長肖明松)
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